客座博客文章Yongqun他,他是新推出的系列编辑吗疫苗与药物作用机理研究中的本体论(vdomsme)主题系列。VDOSME讲习班提供了一个平台，用于讨论生物医学本体论的开发和应用以表示和分析疫苗和药物方面的问题和解决方案。在这篇博文中，他探讨了本系列中发表的前沿研究如何对该领域做出有价值的贡献。

疫苗和药物对全球公共卫生的显著改善作出了贡献。尽管治疗性疫苗正在被发明，疫苗的使用通常是为了防止出现医疗问题。化学药物通常用于治疗医学问题。尽管如此，疫苗和化学药物在研发、制造、临床试验、政府批准和监管以及许可后使用监督和监测方面都受到类似的监管。从更广泛的角度来看，疫苗是一种特殊类型的药物。

研究疫苗和药物的机制和效果具有挑战性，但也很关键。对其机制和作用的基本认识对合理设计疫苗和药物、避免宿主产生不良反应具有重要意义。接种疫苗和用药的效果包括两个方面:积极的预期宿主反应和消极的不希望的不良宿主反应(即不良反应)。不良反应是指在注射疫苗或药物后发生的对疫苗和药物使用的意图不利的病理身体反应。不良事件可能由接种疫苗或药物引起，也可能不是。由注射疫苗或药物引起的不良事件称为疫苗或药物的因果不良事件或不良反应。如何识别疫苗/药物给药与宿主反应之间的因果关系一直是一个深入研究的课题。可能涉及许多因素，包括疫苗/药物的配方、剂量、途径、给药频率、宿主基因型、宿主健康状况等。由注射大量疫苗和药物引起的生物过程的详细机制在很大程度上仍不清楚。

生物医学本体是一组术语，代表生物医学世界中的实体以及它们之间的关系。为了支持自动推理，本体术语与文档和定义相关联，并使用形式化的本体语言用逻辑定义的关系组织。本体论极大地改变了生物医学研究的进行方式。的基因本体论(GO)是一个著名的本体示例，其创建的主要目的是为命名不同类型的生物过程、细胞组件和分子功能提供受控的和标准化的术语。GO允许不分物种起源的基因产物属性的共同表示。创建这种基于本体的注释对于查询数据库和分析高吞吐量数据都非常有价值。自从GO在2000年首次发表以来，GO已经被广泛使用，PubMed上有2000多篇同行评审的出版物引用了GO，谷歌Scholar上有大约30000篇文献引用了GO。

那么，我们在疫苗和药物领域有生物医学本体论吗?如果有，它们如何帮助疫苗和药物的研究、开发和临床支持?在过去的几十年里，许多疫苗和药物相关的术语系统和本体得到了发展，并得到了广泛的应用。例如，受控术语系统国家药品文件-参考术语(ReNorm NDF-RT)管理活动医学词典(MedDRA),系统化的医学命名法(SNOMED)已被普遍用于代表药物、疫苗和与疫苗/药物使用相关的各种不良事件。最近生成的疫苗本体(VO)已被用来本体地表示疫苗、疫苗配方和疫苗诱导的免疫反应。的不良事件本体(探索)和不良事件报告本体(AERO)已被用于代表和报告不良事件的各个方面。这些系统已被广泛应用于临床和研究。

为科学家提供一个平台，展示研究进展，分享想法，解决问题，并促进合作，以更好地表达和分析疫苗和药物相关术语以及临床研究和数据，研讨会"疫苗与药物本体机制与作用的研究(VDOSME)于2012年7月21日在德国格拉茨举办。本次研讨会是第三届国际生物医学本体论会议(2012年高级员工)．已获取vdomisme 2012详细信息在线．在这次研讨会上，口头发表了六篇全文论文和一篇短文。讨论了许多主题，包括药物和疫苗本体信息学之间的关系，不良事件相关本体的更新，以及未来的挑战和机遇。与会者一致认为，这样的研讨会对基于社区的疫苗和药物相关本体的开发和应用非常有益。这六篇全文论文已获邀扩展，并已被接受在一份主题系列在生物医学语义学杂志(JBMS)。

Yongqun他是他组，开展干实验室生物信息学研究和湿实验室布鲁氏菌微生物学和免疫学研究。他也是一名副教授实验动物医学单位(乌兰)和微生物与免疫学学系在密歇根大学．