新型数据集成框架

Anduril是由Sampsa Hautaniemi及其同事开发的分子和临床信息结合分析的开源计算框架,允许临床信息与大规模的分子数据集(如转录组、miRNA、单核苷酸多态性、拷贝数变异和甲基化数据)集成。在最近的一次文章发表在基因组医学他们描述了这个工具,并演示了它在多形性胶质母细胞瘤患者数据分析中的实用性癌症基因组图谱

他们对338名多形性胶质母细胞瘤患者的分子和临床数据进行了分析,发现了几种与疾病进展相关的新候选基因。特别是,Moesin基因表达的增加似乎与患者的低生存率有很强的关联,功能分析证实,该基因的缺失抑制了细胞增殖,使其成为对这种尚不清楚的疾病进行进一步研究的一个很好的候选基因。

Anduril的好处包括能够分析异质性的大规模疾病数据,为未来的功能研究生成可测试的预测,并可能被没有生物信息学培训的科学家使用,以解释目前医学基因组研究生成的日益复杂的数据集。

主题:

医学

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