ISMBECB 2019的亮点

BMC生物信息学最近参加了在瑞士巴塞尔举行的年度分子智能系统(ISMB)会议,该会议今年与欧洲计算生物学会议(ECCB)联合举行。这里我们回顾一下其中的一些亮点。

一年一度的分子生物学智能系统国际会议(ISMB)是国际计算生物学学会(ISCB)的旗舰会议。欧洲计算生物学会议(ECCB)是一次重要的生物信息学和计算生物学会议,每两年与ISMB会议联合举行一次。ISMB/ECCB汇集了来自计算机科学、分子生物学、数学、统计学和其他相关领域的人们,展示了生物信息学和计算生物学的最佳和最新发展。

会议的重点是其特殊利益群体,即COSIs。共有20个COSI课程和研讨会,都代表了计算生物学领域的主要研究领域。

ISMBECB 2019在瑞士巴塞尔举行。总的来说,会议非常关注其特殊利益群体,即COSI。今年的会议上有20个COSI轨道和研讨会,都代表了计算生物学领域的主要研究领域。作为会议的一部分,每个COSI都运行自己的会话(COSI轨道)。还有一些特别会议、技术轨道和两个特别轨道(关于从大数据到知识(BD2K)和万能药).

正如您可以想象的那样,从这样一个全面的、多轨道的计划中,这里不可能涵盖所有内容。但这里是一些亮点的简要总结。

演讲嘉宾

与ISCB会议的一贯情况一样,一些著名的主旨发言人为代表们做了大量精彩的演讲。

其中包括尼古拉斯·拉杰夫斯基,来自Max Delbrück分子医学中心,介绍了他利用单细胞方法研究基因时空调控的工作,威廉·斯塔福德·诺布尔来自华盛顿大学,利用机器学习方法来获得复杂基因组或蛋白质组数据的洞察力。克里斯托夫·德西莫兹,他讨论了他关于标杆管理的挑战和回报的研究。

相当令人兴奋的是,这次会议提供了直播所有未能出席的ISCB成员的杰出主题演讲。

奖品

每年,ISCB颁发四个奖项以表彰具体成就由该领域的研究人员提供。

今年,其中包括最近加入该组织的ISCB创新者奖得主威廉·斯塔福德·诺布尔(William Stafford Noble)BMC生物信息学作为副编辑的编辑委员会

其他获奖者包括邦妮·伯杰(ISCB成就奖获得资深科学家奖)、巴布·布莱恩特(ISCB杰出贡献奖)和克里斯托夫·德西莫夫(ISCB奥弗顿奖)。

支持年轻科学家

但是,这次会议不仅仅是关于该领域的顶尖科学家。会议以为期一天的学生专题讨论会开始,包括深度学习模型的可解释性、大型生物数据的可视化和可重复研究工具等广泛主题的教程。

会议上展出了1100多张海报,其中许多来自早期职业研究人员,生动的会议让年轻科学家有机会谈论他们的工作;在整个会议上,有来自不同类别的海报,主题非常多样关于蛋白质催化位点能量冲突的研究,镰状细胞病本体论,艰难梭菌感染的免疫反应建模,“南丁格尔”,这是一个可重用的数据可视化组件库和一些关于生物信息学教学和教学资源的海报。

会议还介绍了CompBio Ignite讲座,为未被选为口头陈述的研究人员提供了在整个午餐时间进行六分钟所谓“照明风格”讲座的机会。

支持科学界

如前所述,ISMB与许多特殊利益群体(COSI)建立了良好的合作关系,包括SysMod:生物系统的计算建模,MLCSB:计算和系统生物学中的机器学习3DSIG:结构生物信息学和计算生物物理学.

来自SIB瑞士生物信息学研究所的Torsten Schwede在3DSIG会议上发表的主旨演讲是对自动化蛋白质结构同源建模服务器Swiss-MODEL 25年的庆祝,它的最新进展以及在整个开发过程中吸取的一些关键经验教训。

MLCSB COSI会议上最有趣的演讲之一介绍了DrugCell,这是一种基于“可见”神经网络的人工智能,预测抗癌药物反应,同时考虑药物本身的结构特征以及受影响细胞的基因组特征。研究人员发现,效果最好的化合物是长春新碱,神经网络突出了受药物影响的明确途径,如细胞粘附和分裂。

而由特雷·艾德克(Trey Ideker)所作的SysMod主旨演讲则介绍了癌症地图倡议,该项目的目标是制作癌细胞基因和蛋白质接线图的完整地图,这些信息对于开发用于基础和临床研究的癌细胞计算模型至关重要。

最后印象

这次会议给我留下深刻印象的一件事是对年轻研究人员的支持,不仅是在培训计划方面,而且让他们有机会向专业观众描述他们的研究,以及建立网络和建立合作的可能性。计算生物学领域令人兴奋,节奏很快,我特别喜欢MLCSB课程,听到更多关于长生不老药以及他们为支持该领域最重要的资源所做的工作。我期待着参加明年在蒙特利尔举行的ISMB会议。

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