一个最近的研究出版于基因组生物学通过从费城医师学院的穆特博物馆（Mütter）博物馆对天花疫苗接种试剂盒进行测序，探索了天花疫苗接种的早期历史。

1796年，疫苗接种的开端通常会归功于英格兰的爱德华·詹纳（Edward Jenner），尽管以前有各种各样的人以前观察到，感染了牛波克的挤奶器免疫可免疫从天花中感染。詹纳（Jenner）从牛奶妈妈莎拉·尼尔姆斯（Sarah Nelmes）的牛波克斯病变中取出脓液，并将其接种成一个8岁男孩詹姆斯·菲普斯（James Phipps）。随后，他向Phipps注射了天花感染中的材料，而Phipps没有继续发展天花。这个过程很快就在英国陷入困境，并迅速传播到欧洲其他地区和美国。由于使用牛波克病毒，该技术被称为疫苗接种，，，，from the Latin for cow,VACCA。

在1930年代，结果表明，用于疫苗接种的疫苗病毒与牛pox疫苗不同，后来的遗传分析表明，疫苗离疫苗更接近马波克斯。因此，疫苗的起源尚不清楚。众所周知，Jenner还尝试了Horsepox病毒进行疫苗接种，但尚不知道是否使用CowPox或Horsepox进行了早期疫苗接种计划。货物何时成为用于疫苗接种的主要病毒何时尚不清楚。还是它是源自马波克斯或牛pox（或何时发生这种差异），还是它是第三种独立的病毒。

Duggan及其同事的工作试图阐明这一点。他们可以使用可追溯到19世纪中叶的五个疫苗接种套件（最有可能在1859年至1873年之间）。其中四个套件包含折叠的柳叶囊，用于混合淋巴的玻璃载玻片和用于储存scabs的锡盒；第五个是“自动疫苗接种器”，该工具旨在与淋巴或结ab涂在玻璃板上的混合物中。

团队从套件中提取材料并对DNA进行了测序。来自不同试剂盒的病毒序列紧密聚集在一起，表明此时费城正在使用狭窄的疫苗菌株。他们还与1902年在费城产生的商业菌株以及一个已知的骑马基因组产生的疫苗接种序列，在其他疫苗菌株中的进化枝中，并与牛波克斯序列分开。

除疫苗的起源外，这项研究还阐明了当时美国的疫苗接种实践。早期，疫苗菌株通过对人的接种而传播。从套件中提取的大量人类序列表明情况就是如此。五个疫苗宿主中的两名是女性。作者能够从三个试剂盒中产生完整的线粒体基因组，这些序列是西欧亚大陆的典型代表。这是值得注意的，因为一个frican American slaves were often used to propagate the virus，特别是在南部州。

尽管这项研究最终尚未清除疫苗的起源，但它表明，在詹纳初步实验，vaccinia而非牛肝菌的50年后，它被用于疫苗接种。